在使用种子发芽箱进行试验的时候并不是万能的，在使用过程中人们经常会存在很多人之上的错误点，主要表现在以下几个方面：虽然说可任意设定各个实验段运行时间、温度、湿度、光照值。但是箱内的各层的温差还是有的，不同层次，不同区域的地位的温差还是存在的。同一层的里面以及外面的温度也有差异，容积较大的培养箱上面的下面的里面的外面的温差就更加大所以希望在使用的时候尤为注意这个问题。因而在使用过程中可以先使用温度计进行测量之后，发现精密种子发芽箱的上面一层的温度并不是的，种子发芽箱箱体的中部温度；智能人工气候培养箱内的实际温度与箱体的温度还是有一定的差异，一般事项体内的高于箱外设置的温度，主要原因是里面植物的呼吸以及光合作用；在进行使用智能人工气候培养箱的时候要根据，发芽用的种子数目相对应来进行测量而不一定是越大越好。

种子发芽箱是用于培育种子时用到的培养箱，能够人为设定种子发芽时索需要的合适的温度、湿度、光照度等参数，因此，是实验室的仪器。在植物生长过程中，适宜的环境能够让植物健康快速的成长，环境中的各因素之间是相互影响，相互促进的。而在环境中的这些因素均是可变动性的，很难进行调控，及时调控也是极为的不方便。为一些研究带来很大的不变性，也正是因为如此各机构加大研究力度，精密种子发芽箱等一起就相继问世了，这些仪器解决了环境中个因素的不可调节性，方便大家进行试验以及种子发芽。